Das Sprachenzentrum der Universität Basel unterhält Kooperationen mit anderen Institutionen der Universität Basel:

• Departement Pharmazeutische Wissenschaften
• Departement für Sport, Bewegung und Gesundheit
• Konfuzius-Institut an der Universität Basel
• Offener Hörsaal
• Seminar für Nahoststudien
• Slavisches Seminar
• Swiss TPH
• Zentrum für Afrikastudien
• Zentrum für Jüdische Studien

sowie mit anderen Bildungseinrichtungen:

• Fachhochschule Nordwestschweiz (FHNW)
• Musik-Akademie Basel
• Universitätsspital Basel
• Università della Svizzera italiana (USI)

Die Zusammenarbeit sieht die Organisation von Sprachkursen, Kursprogrammen, Schulungen, Kolloquien etc.; auch die Nutzung von Schulungsräumen des Sprachenzentrums ist möglich.